美国、英法、俄罗斯、土耳其、伊朗、沙特等国的秘密情报人员几乎都在叙利亚境内活动，除了刺探情报外，主要就是拉拢甚至控制各类武装，在叙北部，不少亲土武装的首领就是土耳其情报局人员，这一点已经不是什么秘密，很多无法公开进行的军事行动，都需要这些代理人武装出面。
与此同时，一股不可忽视的力量，就是叙利亚军方情报部门，虽然叙利亚空军情报部已经表现出明显的离心倾向，从老阿萨德清除异己的工具，变得更加有独立性，甚至其首领敢于直接批评现任总统阿萨德，并拥有老虎部队这类直属军事力量，但即便是以色列摩萨德也承认，他们的叙利亚同行正变得越来越难以对付：巴沙尔对叙利亚情报机构进行了一定程度的改革，由过去的以数量为主变成以质量为主，工作效率大大提高。
在叙利亚内战中，除了在不同反对派之间制造摩擦引发内讧，暗杀不同派别的武装头目外，叙利亚情报部门还在诸多反对派和极端武装中安插了大量卧底或者收买了不少高级成员，这一点早就被证实，在东古塔突然崩溃的拉赫曼军团，就已被证实，其大法官就是一名叙军卧底。
近日，又有一名叙军卧底被公开，在德拉省向叙军投降的自由军南方阵线主要头目优素福·阿瓦德，在返回政府军这边后，公开身份，此前其一直担任Seif Al-Sham旅的前军事指挥官，但暗中一直为叙利亚军事情报部门做事，直到叙利亚自由军（FSA）和他们的盟友同意交出他们在叙利亚南部的领土。
显然，这不是叙军情报部门安插在反对派中的最后一名卧底，不管是土耳其支持的叙利亚自由军，还是美国支持的叙利亚民主军，其本身都是松散的联盟，派系复杂，不用挑动就经常内部发生火并，给了叙军情报部门渗透之机。不过，叙军内部也不是铁板一块，各路武装之间的暗战一直在激烈进行。